Държавно предприятие „Пристанищна инфраструктура“ е изпълнило успешно редица проекти за модернизиране и поддържане на инфраструктурата на речните и морски пристанища за обществен транспорт в България със собствени средства и с европейско финансиране. ДППИ е било събенефициент по проекти по ОП „Югоизточна Европа“ 2007 – 2013 г., свързани с предотвратяването на замърсяването на водата, въздуха и инфраструктурата в пристанищните райони. Предприятието е изпълнило и редица проекти, финансирани чрез ОП „Транспорт“ 2007 – 2013, Оперативна програма „Транспорт и транспортна инфраструктура” 2014 – 2020 г. (ОПТТИ), Програма „Иновации в зелената индустрия“ в България, Програмата за транснационално сътрудничество „Дунав“ 2014-2020, Програма „Транснационално сътрудничество „Балкани – Средиземно море“ 2014-2020 и проекти по Механизма за свързване на Европа (МСЕ).
